受欧盟新食品法以及日本《食品中残留农业化学品肯定列表制度》的影响，2006年，我国农产品通过上海口岸对欧日等主要市场出口增速明显放缓。据统计，2006年上海口岸对日出口农产品9亿美元，比2005年增长1.7％，远低于2005年比上年11.5％的增速；去年对欧盟出口4.2亿美元，比2005年增长16％，比2005年较上年的增速回落5.7个百分点。
上海口岸2006年农产品出口增速仅比2005年提高1.1个百分点，出口总额27.6亿美元，比2005年增长10.2％。2006年，上海口岸出口额超过1亿美元的各类农产品中，深加工农产品均呈现增长态势，其中蔬菜水果制品、杂项食品和糕饼等谷物粉制品出口额分别达2.3亿美元、2.2亿美元和1.5亿美元，比2005年分别增长22.1％、37.7％和19％。
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