2020年，巴彦淖尔市市场监管局与市农牧局联合下发《巴彦淖尔市试行食用农畜产品合格证制度实施方案》，从产地和市场两头发力，共同推动食用农畜产品合格证制度在该市有效落实，给巴彦淖尔市农畜产品上市贴上“身份证”，为切实保障农畜产品质量安全提供支持。
食用农畜产品合格证一端连着生产者，一端连着消费者，实现产品来源可溯、信息可查、责任可追。合格证制度的主体是食用农畜产品生产企业、农民专业合作社、家庭农场，并逐步向小农户推进。试行的品类包括蔬菜、水果、活畜禽、禽蛋、养殖水产品等食用农畜产品，基本覆盖了农畜产品质量安全监管的重点和难点。消费者可以依据“合格证”上的信息判断选购农畜产品，一些规模化主体还推行二维码合格证，用手机一扫便知。食用农畜产品合格证制度的试行，保障了消费者在选购农产品时的知情权，提供了判断选择标准，极大地维护了农畜产品消费者权益，使消费者监督维权有据可依。
从2020年7月1日起，以该市临河区为试点，在三类主体、五大类品种开始试行食用农畜产品合格证制度，入市食用农畜产品必须贴附合格证。以点带面，逐步在其他旗县区推广实施。截至目前，该市累计印发食用农畜产品合格证22000余册，合计66万多份，登记备案各类食用农畜产品责任主体344家，已累计开具合格证2598份，附证上市的产品累计达205.082吨。
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