国际著名学术期刊PLoS Pathogens于2021年7月24日在线发表了上海交通大学农业与生物学院朱勃、陈功友联合团队研究成果“A key antisense sRNA modulates the oxidative stress response and virulence in Xanthomonas oryzae pv. oryzicola”,揭示了稻黄单胞菌稻生致病变种Xanthomonas oryzae pv. oryzicola (Xoc)中sRNA适应氧化应激环境下对水稻致病性的研究机制。
原核生物和真核生物中除了三种经典的 RNA,如 tRNA, rRNA,和 mRNA 外,还存在着一类新型的具有重要调控功能的非编码RNA(ncRNA),在细菌中被统称为 small RNA(sRNA),大小在 50-500nt 之间,主要作用方式是通过碱基互补配对与靶标基因 mRNA结合,进而影响 mRNA 的稳定性和翻译从而在转录水平上调控基因表达。研究团队发现sRNA Xonc3711通过碱基互补配对靶标DNA结合蛋白Xoc_3982影响其转录水平,ChIP-Seq表明Xoc_3982能够与三型效应因子XopC2结合从而影响其致病性。sRNA Xonc3711通过增加生物膜的形成来增加氧化应激耐受性和和在水稻上的毒性(图)。目前对于稻黄单胞菌稻生致病变种Xoc中sRNA的生物学功能仍处于研究初始阶段,因此开展sRNA 的研究,并发现具有重要功能的 sRNA,对进一步揭示细菌致病机理等和防控所致的植物病害提供了新的思路。
上海交通大学农业与生物学院博士研究生吴言和王赛为论文的共同第一作者,上海交通大学长聘教轨副教授朱勃和长聘教授陈功友为论文的共同通讯作者。朱勃博士2017年以长聘教轨副教授任职交大农业与生物学院。该研究得到了科技部重点研发(项目编号2017YFD0201108和2018YFD0201202)等项目的资助。
论文链接:https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1009762