近日，由内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室完成的“深度混合宏基因组测序挖掘肠道微生物低丰度物种”研究成果发表于肠道微生物领域权威杂志《Gut Microbes》（中科院一区，肠道微生物领域Top期刊），题目为“Hybrid, ultra-deep metagenomic sequencing enables genomic and functional characterization of low-abundance species in the human gut microbiome”（DOI:10.1080/19490976.2021.2021790）。
该研究采用Illumina与Pacbio混合、超深度宏基因组测序的方法，首次聚焦于发掘肠道中的低丰度物种基因组的功能特征，组装得到475个宏基因组组装基因组（MAG），包括287个低丰度和77个极低丰度基因组。同时，该研究发现微生物基因组生长速率、选择压力及染色体可移动遗传元件频率存在个体异质性，鉴定出数千个染色体外的可移动遗传元件，包括5097个噬菌体和79个新的质粒基因组，为理解肠道生态学和肠道菌群的功能特征提供了新见解。
该项目由国家自然科学基金国际合作重点项目（31720103911）、国家现代农业产业技术体系和内蒙古科技重大专项（2021ZD0014）资助。
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